首先，以个人名义注册的好处是，不管公司将来存在与否，商标的专用权不会随着公司的注销而失效。其次，以公司名义注册的话，商标属于公司所有，商标注册证书上不体现法人本身，你要确定你和你朋友是合伙经营还是怎样？因为商标属于公司，而不是属于某一个人。在这其中，需要注意的是，提供的材料不同，后续的结果也不同的。这主要涉及到以下四个方面：

①、提供的材料不同：公司提供的是营业执照和对应的公章，个人提供的是个体执照和法人身份证；②、商标归属权：一个归公司所有，一个归个人所有;③、稳定性不同：以后公司变更，商标要相应做变更，而个人的身份证一般是不变的，相对稳定；④、所有权支配不同：个人注册权限比较集中，公司注册要由公司决定商标的使用情况。注：不管是公司注册还是个人注册，注册完成后都可以进行转让。所以，不管以个人的注册还是公司的注册，都需要考虑到实际情况，对自己目前和以后都有利的方式去处理